Společnost Amgen začala na trzích střední a východní Evropy podnikat 1. května 2004, kdy se prvních osm zemí tohoto regionu stalo členy EU. Od té doby se aktivity společnosti na středoevropských trzích neustále rozšiřují. Mezi nejdůležitější trhy, na které se Amgen ve střední a východní Evropě soustředí, patří České republika, Polsko, Maďarsko, Slovensko a Rumunsko, ale firma vyvíjí aktivity i v Litvě, Lotyšsku, Estonsku, Slovinsku v Bulharsku.

Na český trh vstoupil Amgen v květnu 2004.

Sídlo společnosti je v centru hlavního města, ale její tým pokrývá celé území republiky. V současnosti má česká pobočka přes 60 zaměstnanců.